Nguyễn Văn Lý đã để lại nhiều trước tác như Đông Khê thi tập (3 tập - ký hiệu A. 1873, VHv.2374,A.2439 - Viện Hán Nôm), Đông Khê văn tập (ký hiệu VHv. 2375- Viện Hán Nôm), Chí Am Đông Khê thi tập (ký hiệu A.391 - Viện Hán Nôm), Chí Hiên thi thảo (ký hiệu A.390 - Viện Hán Nôm, Thọ Xương Đông Tác Nguyễn thị tông phả (Ký hiệu A.1331 - Viện Hán Nôm), Đông Tác Nguyễn thị gia huấn (ký hiệu A.673 - Viện Hán Nôm)...

Trong các tác phẩm của mình, Nguyễn Văn Lý có một nét tư tưởng khá tân tiến ngay từ đầu những năm 1830 như trong bài "Qua vùng lăng miếu nhà Lê" ở Bố Vệ Thanh Hóa:

Thiên đạo hữu hưng hoàn hữu phếCổ lai năng cửu bất năng cườngLam Sơn giai khí quy thiên cổĐiểu thử vô tình ngữ tịch dương

Dịch thơ:

Đạo lớn có hưng thì có phế,Nước không mạnh mãi, dẫu dài lâu.Lam Sơn phong khí thành thiên cổ,Nháo nhác dơi bay rộn bóng chiều.